bg image

Catherine Ragimbeau – Responsable des protocoles techniques de séquençage en microbiologie

Catherine Ragimbeau – Responsable des protocoles techniques de séquençage en microbiologie
2020 06-08
(Deutsche Fassung, siehe unten)

Quelle est votre expertise et comment en êtes-vous venu à combattre le Covid-19 ?

Je suis ingénieur de laboratoire en microbiologie, responsable de la plateforme de séquençage en microbiologie et de la formation du personnel aux nouvelles technologies. Dans le cadre de mon travail quotidien en laboratoire, cela signifie que je développe, optimise et teste des protocoles techniques. Bien sûr, le séquençage du Covid-19 est une demande particulière du moment assortie d’un défi technique puisque nouveau.

Quel est votre rôle au sein de l’équipe Covid-19 Fighters du LNS ?

Dans une première étape, mon rôle a été d’adapter les protocoles existants pour le séquençage du Covid-19 et de mettre en place une version validée dans notre laboratoire. Actuellement, je suis en charge de la gestion des séries d’échantillons à séquencer et je coordonne et soutiens l’équipe. En un mot, je suis la personne que l’on appelle si quelque chose se passe mal ou différemment de ce qui était prévu.

Comment coopérez-vous avec d’autres institutions dans la lutte contre le Covid-19 ?

Au quotidien, nous collaborons activement avec d’autres institutions au niveau international et de façon très ouverte. Dès le début de la crise, il y a eu beaucoup d’échanges de protocoles de laboratoire au sein des différentes équipes de recherche. Par exemple, nos collègues portugais nous ont transmis un protocole très utile, qui nous a permis de gagner beaucoup de temps dans la mise en œuvre du séquençage du coronavirus. Par ailleurs, la plateforme d’échange « Artic Network » permet aux équipes du monde entier d’accéder gratuitement à des conseils et à des protocoles. En retour, nous étions aussi heureux de partager nos résultats avec d’autres scientifiques. Notre protocole de séquençage optimisé a été par exemple publié sur la plateforme européenne ECDC afin que d’autres équipes dans le monde puissent bénéficier de notre expérience.

« Fight » (combat) est synonyme de travail acharné et de détermination : quels sont les obstacles auxquels vous avez dû faire face ?

Il y a eu un problème majeur à surmonter et assez inattendu, à savoir la panne du séquenceur ! Heureusement, cela n’a finalement pas eu de graves conséquences sur notre travail. La réparation de l’appareil a cependant nécessité l’intervention d’un technicien au LNS. Comme il venait de l’étranger, il y a eu des formalités à remplir pour passer la frontière.

Que ferez-vous une fois que vous aurez vaincu le Covid-19 et mis fin à ce combat ?

Ce que j’aime surtout c’est voyager – j’ai donc hâte de pouvoir repartir faire du tourisme bientôt.

*****

Catherine Ragimbeau: In der Mikrobiologie verantwortlich für technische Protokolle zur Sequenzierung

Erzählen Sie uns ein wenig von Ihrer Erfahrung, und wie Sie Covid-19 Fighter wurden.

Ich bin in der Mikrobiologie als Labor-Ingenieurin für die Sequenzier-Plattform verantwortlich. Im Laboralltag bedeutet das konkret, dass ich die technischen Protokolle entwickle, optimiere und prüfe. All das ist natürlich gerade jetzt besonders gefragt. Zudem weise ich Mitarbeiter in neue Technologien ein.

Was ist Ihre Aufgabe im Covid-19 Fighter-Team des LNS?

Meine Aufgabe war es zunächst, bestehende Protokolle für die Sequenzierung von Covid-19 anzupassen und eine geprüfte Version bei uns im LNS zu implementieren. Aktuell bin ich für die Durchführung entsprechender Proben verantwortlich und koordiniere bzw. unterstütze das Team. Sagen wir es so: Ich bin die Person, die gerufen wird, wenn etwas schief geht oder anders verläuft, als erwartet.

Wie arbeiten Sie im Kampf gegen Covid-19 mit anderen Institutionen zusammen?

Wir nehmen eine sehr offene internationale Zusammenarbeit wahr. Seit dem Beginn der Krise findet innerhalb des internationalen Forschungs-Ökosystems ein umfassender Austausch von Laborprotokollen statt. So haben uns portugiesische Kollegen ein sehr hilfreiches Protokoll übermittelt, auf dessen Grundlage wir bei der Implementierung der Sequenzierung des Corona-Virus sehr viel Zeit gewinnen konnten. Zudem bietet die Austausch-Plattform Artic Network Teams in der ganzen Welt freien Zugang zu Tipps und Protokollen. Und auch wir selbst teilen unsere Resultate gerne mit Kollegen: So wurde unser optimiertes Sequenzier-Protokoll auf der europäischen Plattform ECDC veröffentlicht, damit auch andere Teams weltweit von unserer Erfahrung profitieren können.

„Fight“, oder: Kampf, das bedeutet harte Arbeit und Entschlossenheit. Welche Hürden mussten Sie bisher nehmen?

Da gab es vor allem eine große Hürde zu nehmen, nämlich als der Sequenzer kaputt ging. Am Ende lag zum Glück kein gravierender Schaden vor. Der Aufwand war dennoch erheblich, da ein Techniker im LNS vorbeikommen musste. Und weil der aus dem Ausland kam, war dies mit einigen Formalitäten verbunden.

Was werden Sie tun, wenn Sie Covid 19 besiegt haben?

Ich sage es mal so: Ich reise sehr gerne – und freue mich deshalb darauf, irgendwann wieder auf Reisen gehen zu können.