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Le projet national de séquençage LuxGen entre dans une nouvelle phase : le LNS et le LIH forment une équipe de recherche commune

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Le projet national de séquençage LuxGen entre dans une nouvelle phase : le LNS et le LIH forment une équipe de recherche commune
2021 09-23

Le Laboratoire national de santé (LNS) et le Luxembourg Institute of Health (LIH) étendent encore leur collaboration dans le domaine de la recherche biomédicale et de la médecine translationnelle. En s’appuyant sur la plateforme LuxGen existante, qui a été lancée en 2018, le LNS et le LIH ont signé un nouvel accord de collaboration pour transformer l’infrastructure de séquençage existante en un centre de génomique commun de recherche et de compétence. En juillet 2021, une équipe conjointe LNS-LIH a été mise en place pour former un pôle de séquençage unique situé au National Center of Genetics (NCG) du LNS.

Cette collaboration renforcée du personnel du LNS et du LIH représente une nouvelle étape pour la recherche génétique au Luxembourg et pour la plateforme de séquençage LuxGen. Cette dernière a été créée pour partager l’expertise, inspirer la recherche translationnelle conjointe, tirer parti des investissements à grande échelle et ouvrir la voie à un consortium national de séquençage. Aujourd’hui, LuxGen est le premier centre de séquençage au Luxembourg et offre un accès à une série de tests basés sur le séquençage de nouvelle génération (NGS) en mettant l’accent sur les projets de recherche translationnelle et clinique.

Priorité à l’oncologie personnalisée et aux maladies rares

LuxGen est placé sous la gouvernance d’un comité directeur conjoint LIH-LNS. À la tête de l’équipe multidisciplinaire se trouve le Pr Dr Barbara Klink, qui dirige également le NCG. Elle considère que l’oncologie personnalisée et la recherche dans le domaine des maladies rares sont au cœur de la nouvelle initiative LNS-LIH : « Grâce aux technologies de séquençage à haut débit, nous disposons désormais d’outils pour mieux diagnostiquer les maladies, mieux prédire leur évolution et mieux choisir les traitements. La disponibilité du séquençage du génome, à l’intersection de la recherche biomédicale et des soins cliniques, débloque le potentiel de la médecine de précision, en particulier pour les patients atteints de cancer et ceux atteints de maladies héréditaires rares. »

Pour atteindre cet objectif, outre l’acquisition d’une plus grande expertise, LuxGen a considérablement augmenté sa capacité de séquençage en acquérant un séquenceur à l’échelle de production (Illumina NovaSeq6000), le premier instrument de ce type installé dans le pays. Cet appareil de séquençage à haut débit a été mis en service au LNS fin 2020, ce qui a représenté une avancée importante pour les soins aux patients et la recherche biomédicale au Luxembourg. Comme l’explique Barbara Klink : « Grâce au NovaSeq6000, nous avons pu séquencer un génome humain complet pour la toute première fois au Luxembourg. Avant cela, la technologie nécessaire n’était tout simplement pas disponible dans le pays. Nous étions donc dépendants de partenaires étrangers, notamment pour les approches de séquençage de plus grande envergure. Cette situation a maintenant changé et nous nous réjouissons des perspectives en matière de soins aux patients. »

La coordination des opérations de LuxGen est assurée par le Dr Daniel Stieber, qui considère que la consolidation accrue des activités de séquençage dans une installation centrale commune LNS-LIH est un atout important pour stimuler les projets de recherche translationnelle à grande échelle dans le pays : « LuxGen est maintenant en mesure d’offrir une variété de techniques importantes basées sur le NGS et une expertise avancée pour la conception de projets et l’analyse de données qui renforcera cet aspect. »

Une initiative stratégique avec un bénéfice direct pour les patients

L’expertise en biologie moléculaire avancée, en séquençage ainsi qu’en pipelines d’analyse de données bioinformatiques de base est fournie au centre LuxGen par le personnel d’ingénierie, technique et bioinformatique du LIH. Selon le Pr Dr Simone Niclou, directrice du département d’oncologie du LIH, cette initiative revêt une grande importance stratégique pour le LIH, dont la mission est la recherche biomédicale translationnelle avec un bénéfice direct pour les patients :

« Le LIH est particulièrement actif dans les domaines de la recherche sur le cancer et les troubles immunitaires et neurologiques. S’appuyant sur le partenariat LIH-LNS qui s’est développé au cours des dernières années dans le domaine du séquençage de nouvelle génération (NGS), et sur la nécessité d’un profilage génomique à grande échelle dans le cadre de la médecine de précision, le LIH et le LNS ont souhaité étendre conjointement le champ d’application d’une plateforme de séquençage « pure » à un centre de séquençage collaboratif dans lequel l’accès aux instruments, au laboratoire, au personnel et à l’expertise est partagé. C’est ainsi qu’est né le nouveau centre de séquençage LuxGen, mis en œuvre dans le cadre d’un partenariat bilatéral LNS-LIH. »

Un regroupement cohérent de l’expertise et de l’infrastructure technologique

Le Prof. Dr Friedrich Mühlschlegel, directeur du LNS, voit également dans cette prochaine étape du projet LuxGen la mise en pratique d’un principe essentiel du Luxembourg en tant que centre d’excellence en matière de recherche : « Dans le domaine de la médecine en particulier, le Luxembourg s’appuie sur une coopération très étroite entre les différents acteurs et leurs équipes internationales. Avec le projet LuxGen, nous continuons à mettre en œuvre cette approche de manière cohérente et à regrouper durablement les compétences polyvalentes et les infrastructures technologiques existantes. LuxGen, qui espère attirer d’autres partenaires à l’avenir, est une étape importante sur la voie d’un programme national de médecine génomique au Luxembourg. »

Lien vers la vidéo présentant le Next Generation Sequencing : https://youtu.be/Cd21t3mGR9o